تُعنى لجنة الأردن بصلات الجمعية مع الأردن، بمواضيع معادلة الشهادات في الأردن والتقديم للبورد الأردني أو البورد العربي. كما تُعنى اللجنة برفع سمعة خريجي ألمانيا في الأردن ومساعدة العائدين إلى الأردن لحل الصعوبات التي يمكن أن تواجههم في الأردن بعد عودتهم من ألمانيا.

كما تُعنى اللجنة بتمثيل أطباء ألمانيا في الأردن والتواصل مع الجهات الرسمية مثل وزارة التعليم العالي ووزارة الصحة، المجلس الطبي الأردني ونقابة الأطباء الأردنية، وذلك لتسهيل معاملات الزملاء العائدين إلى الأردن وتمثيل الأطباء الأردنيين في ألمانيا أمام الجهات الرسمية والخاصة في الأردن.

من أهداف لجنة الأردن العمل التطوعي الخيري في الأردن والمساهمة في تطوير المنظومة الصحية الأردنية لتبقى رائدةً على المستوى العربي ولنرقى بالمنظومة إلى المستويات الدولية. كما تسعى الجمعية إلى المساندة في تقديم الخدمات الطبية للمحتاجين إليها والاستفادة من التجربة الألمانية في تحقيق الخدمة الطبية لكل فئات المجتمع كواجب إنساني على الأطباء.